A actividade científica é desenvolvida em 4 Centros de Investigação (LIBPhys-UNL, CEFITEC, CENIMAT/I3N e CeFEMA) por 36 doutores, 29 doutorandos e 4 Pós-Doc, que desenvolvem a sua actividade científica no DF e noutros Departamentos da FCT/UNL. O seu trabalho de investigação abrange diversas áreas, tais como nanofísica e energia, física atómica e molecular, física nuclear e dos plasmas, física das interfaces, lasers e optoelectrónica, detectores, criogenia, técnicas analíticas aplicadas à saúde e património cultural, instrumentação médica e imagem médica.